Protein–RNA interactions for Protein: P70441

Slc9a3r1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3r1P70441 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc9a3r1P70441 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc9a3r1P70441 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc9a3r1P70441 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc9a3r1P70441 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc9a3r1P70441 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc9a3r1P70441 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc9a3r1P70441 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc9a3r1P70441 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc9a3r1P70441 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc9a3r1P70441 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc9a3r1P70441 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc9a3r1P70441 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc9a3r1P70441 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc9a3r1P70441 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc9a3r1P70441 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc9a3r1P70441 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc9a3r1P70441 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc9a3r1P70441 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc9a3r1P70441 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc9a3r1P70441 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc9a3r1P70441 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc9a3r1P70441 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc9a3r1P70441 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc9a3r1P70441 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc9a3r1P70441 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc9a3r1P70441 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc9a3r1P70441 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc9a3r1P70441 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc9a3r1P70441 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc9a3r1P70441 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc9a3r1P70441 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc9a3r1P70441 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc9a3r1P70441 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc9a3r1P70441 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc9a3r1P70441 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc9a3r1P70441 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc9a3r1P70441 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc9a3r1P70441 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc9a3r1P70441 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc9a3r1P70441 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc9a3r1P70441 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc9a3r1P70441 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc9a3r1P70441 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc9a3r1P70441 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc9a3r1P70441 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc9a3r1P70441 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc9a3r1P70441 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc9a3r1P70441 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc9a3r1P70441 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc9a3r1P70441 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc9a3r1P70441 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc9a3r1P70441 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc9a3r1P70441 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc9a3r1P70441 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc9a3r1P70441 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc9a3r1P70441 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc9a3r1P70441 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc9a3r1P70441 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc9a3r1P70441 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc9a3r1P70441 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc9a3r1P70441 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc9a3r1P70441 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc9a3r1P70441 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc9a3r1P70441 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc9a3r1P70441 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc9a3r1P70441 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc9a3r1P70441 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc9a3r1P70441 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc9a3r1P70441 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc9a3r1P70441 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc9a3r1P70441 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc9a3r1P70441 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc9a3r1P70441 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc9a3r1P70441 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc9a3r1P70441 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc9a3r1P70441 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc9a3r1P70441 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc9a3r1P70441 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc9a3r1P70441 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc9a3r1P70441 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc9a3r1P70441 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc9a3r1P70441 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc9a3r1P70441 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc9a3r1P70441 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc9a3r1P70441 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc9a3r1P70441 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc9a3r1P70441 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc9a3r1P70441 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc9a3r1P70441 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc9a3r1P70441 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc9a3r1P70441 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc9a3r1P70441 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc9a3r1P70441 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc9a3r1P70441 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc9a3r1P70441 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc9a3r1P70441 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc9a3r1P70441 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc9a3r1P70441 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc9a3r1P70441 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms