Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfi1P70338 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfi1P70338 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfi1P70338 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfi1P70338 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfi1P70338 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfi1P70338 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfi1P70338 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfi1P70338 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfi1P70338 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfi1P70338 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfi1P70338 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfi1P70338 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfi1P70338 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfi1P70338 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfi1P70338 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfi1P70338 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfi1P70338 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfi1P70338 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfi1P70338 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfi1P70338 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfi1P70338 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfi1P70338 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfi1P70338 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfi1P70338 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfi1P70338 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfi1P70338 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfi1P70338 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfi1P70338 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfi1P70338 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfi1P70338 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfi1P70338 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfi1P70338 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfi1P70338 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfi1P70338 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfi1P70338 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfi1P70338 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfi1P70338 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfi1P70338 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfi1P70338 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfi1P70338 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfi1P70338 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gfi1P70338 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gfi1P70338 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gfi1P70338 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gfi1P70338 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gfi1P70338 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms