Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxb13P70321 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms