Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NfixP70257 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NfixP70257 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NfixP70257 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NfixP70257 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NfixP70257 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NfixP70257 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NfixP70257 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NfixP70257 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NfixP70257 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NfixP70257 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NfixP70257 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NfixP70257 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NfixP70257 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NfixP70257 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NfixP70257 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NfixP70257 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NfixP70257 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NfixP70257 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NfixP70257 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NfixP70257 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NfixP70257 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NfixP70257 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NfixP70257 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NfixP70257 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NfixP70257 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NfixP70257 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NfixP70257 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NfixP70257 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NfixP70257 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NfixP70257 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NfixP70257 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NfixP70257 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NfixP70257 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NfixP70257 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NfixP70257 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NfixP70257 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NfixP70257 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NfixP70257 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NfixP70257 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NfixP70257 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NfixP70257 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NfixP70257 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NfixP70257 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NfixP70257 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NfixP70257 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NfixP70257 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NfixP70257 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NfixP70257 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NfixP70257 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NfixP70257 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NfixP70257 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NfixP70257 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NfixP70257 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NfixP70257 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NfixP70257 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NfixP70257 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NfixP70257 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NfixP70257 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NfixP70257 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NfixP70257 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NfixP70257 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NfixP70257 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NfixP70257 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NfixP70257 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NfixP70257 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NfixP70257 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NfixP70257 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NfixP70257 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NfixP70257 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NfixP70257 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NfixP70257 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NfixP70257 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NfixP70257 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NfixP70257 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NfixP70257 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NfixP70257 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NfixP70257 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NfixP70257 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NfixP70257 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NfixP70257 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NfixP70257 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NfixP70257 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NfixP70257 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NfixP70257 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NfixP70257 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NfixP70257 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NfixP70257 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NfixP70257 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NfixP70257 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NfixP70257 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NfixP70257 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NfixP70257 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NfixP70257 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NfixP70257 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NfixP70257 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NfixP70257 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NfixP70257 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NfixP70257 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NfixP70257 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms