Protein–RNA interactions for Protein: P63143

Kcnab1, Voltage-gated potassium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnab1P63143 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnab1P63143 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnab1P63143 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms