Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 240.7 ms