Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms