Protein–RNA interactions for Protein: P62737

Acta2, Actin, aortic smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta2P62737 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Acta2P62737 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acta2P62737 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acta2P62737 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acta2P62737 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acta2P62737 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acta2P62737 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acta2P62737 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acta2P62737 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acta2P62737 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acta2P62737 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acta2P62737 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acta2P62737 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acta2P62737 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acta2P62737 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acta2P62737 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acta2P62737 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Acta2P62737 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acta2P62737 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acta2P62737 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acta2P62737 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Acta2P62737 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acta2P62737 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Acta2P62737 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acta2P62737 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acta2P62737 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acta2P62737 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acta2P62737 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acta2P62737 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acta2P62737 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acta2P62737 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Acta2P62737 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Acta2P62737 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acta2P62737 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms