Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smg6P61406 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smg6P61406 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Smg6P61406 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smg6P61406 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smg6P61406 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smg6P61406 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smg6P61406 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smg6P61406 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smg6P61406 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smg6P61406 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smg6P61406 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms