Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Psme3P61290 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psme3P61290 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psme3P61290 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms