Protein–RNA interactions for Protein: P61164

Actr1a, Alpha-centractin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actr1aP61164 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms