Protein–RNA interactions for Protein: P59235

Nup43, Nucleoporin Nup43, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup43P59235 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup43P59235 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup43P59235 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup43P59235 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup43P59235 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup43P59235 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup43P59235 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup43P59235 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup43P59235 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup43P59235 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup43P59235 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup43P59235 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup43P59235 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup43P59235 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup43P59235 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup43P59235 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup43P59235 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup43P59235 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup43P59235 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup43P59235 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup43P59235 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup43P59235 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup43P59235 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup43P59235 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup43P59235 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup43P59235 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup43P59235 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup43P59235 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup43P59235 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup43P59235 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup43P59235 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup43P59235 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup43P59235 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Nup43P59235 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nup43P59235 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Nup43P59235 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nup43P59235 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nup43P59235 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup43P59235 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup43P59235 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms