Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms