Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtnsP57757 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtnsP57757 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtnsP57757 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtnsP57757 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtnsP57757 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtnsP57757 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CtnsP57757 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtnsP57757 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtnsP57757 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CtnsP57757 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms