Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TdgP56581 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TdgP56581 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TdgP56581 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TdgP56581 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TdgP56581 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TdgP56581 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TdgP56581 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TdgP56581 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TdgP56581 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TdgP56581 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TdgP56581 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TdgP56581 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TdgP56581 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TdgP56581 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TdgP56581 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TdgP56581 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TdgP56581 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TdgP56581 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TdgP56581 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TdgP56581 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TdgP56581 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TdgP56581 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TdgP56581 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TdgP56581 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TdgP56581 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TdgP56581 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TdgP56581 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TdgP56581 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TdgP56581 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TdgP56581 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TdgP56581 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TdgP56581 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TdgP56581 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TdgP56581 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TdgP56581 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TdgP56581 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TdgP56581 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TdgP56581 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TdgP56581 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TdgP56581 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TdgP56581 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TdgP56581 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TdgP56581 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TdgP56581 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TdgP56581 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TdgP56581 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TdgP56581 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TdgP56581 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TdgP56581 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TdgP56581 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TdgP56581 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TdgP56581 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TdgP56581 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TdgP56581 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TdgP56581 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TdgP56581 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TdgP56581 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TdgP56581 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TdgP56581 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TdgP56581 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TdgP56581 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TdgP56581 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TdgP56581 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TdgP56581 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TdgP56581 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TdgP56581 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TdgP56581 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TdgP56581 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TdgP56581 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TdgP56581 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TdgP56581 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TdgP56581 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TdgP56581 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TdgP56581 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TdgP56581 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TdgP56581 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TdgP56581 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TdgP56581 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TdgP56581 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TdgP56581 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TdgP56581 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TdgP56581 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TdgP56581 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TdgP56581 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TdgP56581 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TdgP56581 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TdgP56581 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TdgP56581 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TdgP56581 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TdgP56581 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TdgP56581 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TdgP56581 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TdgP56581 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TdgP56581 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TdgP56581 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TdgP56581 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TdgP56581 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TdgP56581 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TdgP56581 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms