Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms