Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp5P56399 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp5P56399 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp5P56399 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp5P56399 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp5P56399 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp5P56399 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp5P56399 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp5P56399 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp5P56399 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp5P56399 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp5P56399 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp5P56399 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp5P56399 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp5P56399 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp5P56399 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp5P56399 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp5P56399 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp5P56399 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp5P56399 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp5P56399 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp5P56399 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp5P56399 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp5P56399 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp5P56399 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp5P56399 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp5P56399 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp5P56399 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp5P56399 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp5P56399 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp5P56399 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp5P56399 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp5P56399 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp5P56399 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp5P56399 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp5P56399 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp5P56399 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp5P56399 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp5P56399 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp5P56399 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp5P56399 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp5P56399 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp5P56399 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp5P56399 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp5P56399 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp5P56399 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp5P56399 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp5P56399 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp5P56399 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp5P56399 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp5P56399 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp5P56399 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp5P56399 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp5P56399 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp5P56399 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp5P56399 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp5P56399 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp5P56399 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp5P56399 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp5P56399 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp5P56399 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp5P56399 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp5P56399 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp5P56399 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp5P56399 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp5P56399 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp5P56399 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp5P56399 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp5P56399 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp5P56399 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp5P56399 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp5P56399 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp5P56399 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp5P56399 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp5P56399 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms