Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GemP55041 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GemP55041 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GemP55041 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GemP55041 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GemP55041 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GemP55041 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GemP55041 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GemP55041 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GemP55041 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GemP55041 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GemP55041 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GemP55041 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GemP55041 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GemP55041 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GemP55041 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GemP55041 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GemP55041 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GemP55041 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GemP55041 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GemP55041 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GemP55041 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GemP55041 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GemP55041 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GemP55041 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GemP55041 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GemP55041 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GemP55041 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GemP55041 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GemP55041 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GemP55041 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GemP55041 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GemP55041 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GemP55041 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GemP55041 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GemP55041 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GemP55041 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GemP55041 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GemP55041 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GemP55041 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GemP55041 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GemP55041 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GemP55041 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GemP55041 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GemP55041 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GemP55041 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GemP55041 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GemP55041 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GemP55041 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GemP55041 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GemP55041 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GemP55041 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GemP55041 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GemP55041 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GemP55041 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GemP55041 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GemP55041 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GemP55041 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GemP55041 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GemP55041 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GemP55041 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GemP55041 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GemP55041 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GemP55041 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GemP55041 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GemP55041 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GemP55041 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GemP55041 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GemP55041 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GemP55041 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GemP55041 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GemP55041 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GemP55041 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GemP55041 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GemP55041 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GemP55041 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GemP55041 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GemP55041 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GemP55041 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GemP55041 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GemP55041 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GemP55041 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GemP55041 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GemP55041 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GemP55041 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GemP55041 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GemP55041 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GemP55041 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GemP55041 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GemP55041 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GemP55041 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GemP55041 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GemP55041 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GemP55041 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GemP55041 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GemP55041 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GemP55041 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GemP55041 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GemP55041 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GemP55041 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms