Protein–RNA interactions for Protein: P55014

Slc12a1, Solute carrier family 12 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,095 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a1P55014 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc12a1P55014 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc12a1P55014 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc12a1P55014 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc12a1P55014 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc12a1P55014 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc12a1P55014 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc12a1P55014 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc12a1P55014 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc12a1P55014 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc12a1P55014 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc12a1P55014 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc12a1P55014 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc12a1P55014 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc12a1P55014 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc12a1P55014 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc12a1P55014 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc12a1P55014 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc12a1P55014 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc12a1P55014 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc12a1P55014 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc12a1P55014 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc12a1P55014 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc12a1P55014 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc12a1P55014 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc12a1P55014 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc12a1P55014 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc12a1P55014 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc12a1P55014 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc12a1P55014 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc12a1P55014 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc12a1P55014 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc12a1P55014 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc12a1P55014 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc12a1P55014 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc12a1P55014 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc12a1P55014 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc12a1P55014 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc12a1P55014 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc12a1P55014 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc12a1P55014 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc12a1P55014 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc12a1P55014 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc12a1P55014 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc12a1P55014 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc12a1P55014 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc12a1P55014 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms