Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms