Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Upp1P52624 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Upp1P52624 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Upp1P52624 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Upp1P52624 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Upp1P52624 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Upp1P52624 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Upp1P52624 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Upp1P52624 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms