Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ClgnP52194 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ClgnP52194 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ClgnP52194 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ClgnP52194 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ClgnP52194 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ClgnP52194 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ClgnP52194 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ClgnP52194 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms