Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms