Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TspoP50637 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TspoP50637 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TspoP50637 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TspoP50637 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TspoP50637 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TspoP50637 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TspoP50637 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TspoP50637 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TspoP50637 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TspoP50637 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TspoP50637 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TspoP50637 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TspoP50637 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TspoP50637 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TspoP50637 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TspoP50637 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TspoP50637 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TspoP50637 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TspoP50637 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TspoP50637 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TspoP50637 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TspoP50637 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
TspoP50637 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TspoP50637 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TspoP50637 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TspoP50637 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TspoP50637 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TspoP50637 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
TspoP50637 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TspoP50637 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TspoP50637 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TspoP50637 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TspoP50637 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TspoP50637 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TspoP50637 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TspoP50637 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TspoP50637 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TspoP50637 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TspoP50637 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TspoP50637 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TspoP50637 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TspoP50637 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TspoP50637 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TspoP50637 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TspoP50637 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TspoP50637 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TspoP50637 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
TspoP50637 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TspoP50637 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TspoP50637 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TspoP50637 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TspoP50637 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TspoP50637 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TspoP50637 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
TspoP50637 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
TspoP50637 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TspoP50637 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TspoP50637 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TspoP50637 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TspoP50637 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TspoP50637 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TspoP50637 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TspoP50637 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TspoP50637 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TspoP50637 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TspoP50637 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TspoP50637 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TspoP50637 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TspoP50637 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TspoP50637 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TspoP50637 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TspoP50637 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TspoP50637 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
TspoP50637 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TspoP50637 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TspoP50637 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TspoP50637 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TspoP50637 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TspoP50637 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TspoP50637 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TspoP50637 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TspoP50637 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TspoP50637 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TspoP50637 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TspoP50637 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TspoP50637 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TspoP50637 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TspoP50637 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TspoP50637 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TspoP50637 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TspoP50637 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TspoP50637 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TspoP50637 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TspoP50637 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TspoP50637 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TspoP50637 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TspoP50637 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
TspoP50637 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
TspoP50637 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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