Protein–RNA interactions for Protein: P49615

Cdk5, Cyclin-dependent-like kinase 5, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5P49615 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5P49615 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms