Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms