Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chd1P40201 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chd1P40201 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Chd1P40201 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chd1P40201 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chd1P40201 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chd1P40201 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Chd1P40201 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chd1P40201 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chd1P40201 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chd1P40201 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chd1P40201 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chd1P40201 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chd1P40201 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chd1P40201 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chd1P40201 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chd1P40201 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chd1P40201 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chd1P40201 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chd1P40201 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Chd1P40201 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chd1P40201 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chd1P40201 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chd1P40201 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chd1P40201 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chd1P40201 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chd1P40201 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Chd1P40201 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Chd1P40201 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Chd1P40201 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Chd1P40201 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Chd1P40201 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Chd1P40201 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Chd1P40201 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Chd1P40201 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chd1P40201 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chd1P40201 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Chd1P40201 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chd1P40201 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chd1P40201 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chd1P40201 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chd1P40201 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chd1P40201 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chd1P40201 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chd1P40201 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chd1P40201 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chd1P40201 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Chd1P40201 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chd1P40201 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chd1P40201 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Chd1P40201 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Chd1P40201 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Chd1P40201 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chd1P40201 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chd1P40201 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chd1P40201 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chd1P40201 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms