Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf2P39429 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf2P39429 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf2P39429 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf2P39429 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf2P39429 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf2P39429 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf2P39429 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf2P39429 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf2P39429 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf2P39429 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf2P39429 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf2P39429 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf2P39429 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf2P39429 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf2P39429 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf2P39429 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf2P39429 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf2P39429 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Traf2P39429 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Traf2P39429 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Traf2P39429 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Traf2P39429 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Traf2P39429 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Traf2P39429 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Traf2P39429 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf2P39429 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf2P39429 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf2P39429 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf2P39429 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf2P39429 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf2P39429 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms