Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Traf1P39428 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Traf1P39428 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Traf1P39428 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Traf1P39428 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Traf1P39428 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Traf1P39428 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Traf1P39428 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Traf1P39428 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Traf1P39428 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Traf1P39428 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Traf1P39428 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Traf1P39428 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Traf1P39428 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Traf1P39428 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Traf1P39428 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Traf1P39428 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Traf1P39428 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Traf1P39428 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Traf1P39428 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Traf1P39428 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Traf1P39428 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Traf1P39428 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Traf1P39428 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Traf1P39428 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Traf1P39428 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Traf1P39428 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Traf1P39428 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Traf1P39428 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Traf1P39428 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Traf1P39428 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Traf1P39428 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Traf1P39428 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Traf1P39428 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Traf1P39428 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Traf1P39428 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Traf1P39428 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Traf1P39428 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Traf1P39428 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Traf1P39428 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Traf1P39428 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Traf1P39428 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Traf1P39428 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Traf1P39428 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms