Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik2P39087 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik2P39087 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik2P39087 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik2P39087 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Grik2P39087 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grik2P39087 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grik2P39087 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grik2P39087 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grik2P39087 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Grik2P39087 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Grik2P39087 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms