Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PtprkP35822 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PtprkP35822 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PtprkP35822 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PtprkP35822 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PtprkP35822 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PtprkP35822 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PtprkP35822 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms