Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms