Protein–RNA interactions for Protein: P35460

Ly6f, Lymphocyte antigen 6F, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6fP35460 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly6fP35460 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms