Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grin1P35438 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin1P35438 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin1P35438 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin1P35438 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Grin1P35438 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grin1P35438 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grin1P35438 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin1P35438 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grin1P35438 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms