Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nedd1P33215 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms