Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc5P32043 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc5P32043 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc5P32043 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc5P32043 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc5P32043 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc5P32043 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc5P32043 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc5P32043 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc5P32043 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc5P32043 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc5P32043 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc5P32043 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc5P32043 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc5P32043 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc5P32043 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc5P32043 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc5P32043 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc5P32043 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc5P32043 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc5P32043 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc5P32043 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc5P32043 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc5P32043 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc5P32043 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc5P32043 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc5P32043 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc5P32043 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc5P32043 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc5P32043 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc5P32043 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc5P32043 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc5P32043 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc5P32043 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc5P32043 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc5P32043 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc5P32043 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc5P32043 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc5P32043 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc5P32043 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc5P32043 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc5P32043 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc5P32043 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc5P32043 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc5P32043 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc5P32043 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc5P32043 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc5P32043 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc5P32043 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc5P32043 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc5P32043 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc5P32043 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc5P32043 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc5P32043 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc5P32043 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc5P32043 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc5P32043 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc5P32043 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc5P32043 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc5P32043 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc5P32043 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc5P32043 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hoxc5P32043 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hoxc5P32043 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc5P32043 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc5P32043 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc5P32043 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc5P32043 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc5P32043 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc5P32043 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc5P32043 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc5P32043 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc5P32043 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc5P32043 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc5P32043 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc5P32043 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc5P32043 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc5P32043 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc5P32043 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc5P32043 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc5P32043 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc5P32043 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc5P32043 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc5P32043 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc5P32043 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc5P32043 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc5P32043 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc5P32043 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc5P32043 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc5P32043 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc5P32043 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc5P32043 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc5P32043 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc5P32043 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc5P32043 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc5P32043 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc5P32043 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc5P32043 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc5P32043 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc5P32043 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms