Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc11P31313 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms