Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms