Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msr1P30204 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Msr1P30204 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msr1P30204 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msr1P30204 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msr1P30204 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msr1P30204 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msr1P30204 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msr1P30204 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msr1P30204 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Msr1P30204 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms