Protein–RNA interactions for Protein: P29268

Ctgf, Connective tissue growth factor, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtgfP29268 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtgfP29268 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtgfP29268 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtgfP29268 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtgfP29268 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtgfP29268 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtgfP29268 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtgfP29268 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtgfP29268 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms