Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtprmP28828 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtprmP28828 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtprmP28828 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtprmP28828 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtprmP28828 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PtprmP28828 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtprmP28828 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PtprmP28828 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtprmP28828 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PtprmP28828 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtprmP28828 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtprmP28828 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtprmP28828 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtprmP28828 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtprmP28828 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtprmP28828 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtprmP28828 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtprmP28828 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PtprmP28828 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtprmP28828 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtprmP28828 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtprmP28828 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtprmP28828 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtprmP28828 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtprmP28828 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtprmP28828 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtprmP28828 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtprmP28828 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtprmP28828 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtprmP28828 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtprmP28828 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtprmP28828 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtprmP28828 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtprmP28828 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtprmP28828 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtprmP28828 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtprmP28828 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtprmP28828 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtprmP28828 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PtprmP28828 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PtprmP28828 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtprmP28828 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtprmP28828 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtprmP28828 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtprmP28828 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PtprmP28828 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PtprmP28828 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PtprmP28828 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PtprmP28828 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PtprmP28828 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PtprmP28828 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PtprmP28828 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PtprmP28828 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PtprmP28828 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PtprmP28828 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PtprmP28828 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PtprmP28828 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtprmP28828 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtprmP28828 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtprmP28828 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtprmP28828 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtprmP28828 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PtprmP28828 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtprmP28828 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtprmP28828 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtprmP28828 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtprmP28828 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtprmP28828 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtprmP28828 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtprmP28828 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PtprmP28828 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtprmP28828 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtprmP28828 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtprmP28828 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtprmP28828 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtprmP28828 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtprmP28828 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtprmP28828 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtprmP28828 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtprmP28828 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtprmP28828 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtprmP28828 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtprmP28828 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PtprmP28828 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtprmP28828 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtprmP28828 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtprmP28828 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtprmP28828 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtprmP28828 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtprmP28828 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtprmP28828 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PtprmP28828 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtprmP28828 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtprmP28828 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtprmP28828 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtprmP28828 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtprmP28828 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtprmP28828 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtprmP28828 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
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