Protein–RNA interactions for Protein: P28659

Celf1, CUGBP Elav-like family member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Celf1P28659 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Celf1P28659 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Celf1P28659 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Celf1P28659 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Celf1P28659 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Celf1P28659 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Celf1P28659 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Celf1P28659 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Celf1P28659 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Celf1P28659 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Celf1P28659 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Celf1P28659 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Celf1P28659 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Celf1P28659 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Celf1P28659 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms