Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms