Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CftrP26361 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CftrP26361 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CftrP26361 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CftrP26361 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CftrP26361 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CftrP26361 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CftrP26361 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CftrP26361 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CftrP26361 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CftrP26361 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CftrP26361 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CftrP26361 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CftrP26361 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CftrP26361 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CftrP26361 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CftrP26361 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CftrP26361 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CftrP26361 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CftrP26361 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CftrP26361 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CftrP26361 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CftrP26361 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CftrP26361 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CftrP26361 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CftrP26361 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CftrP26361 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CftrP26361 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CftrP26361 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CftrP26361 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CftrP26361 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CftrP26361 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CftrP26361 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CftrP26361 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CftrP26361 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CftrP26361 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CftrP26361 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CftrP26361 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CftrP26361 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CftrP26361 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CftrP26361 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CftrP26361 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CftrP26361 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CftrP26361 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CftrP26361 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CftrP26361 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CftrP26361 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CftrP26361 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CftrP26361 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CftrP26361 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CftrP26361 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CftrP26361 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CftrP26361 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CftrP26361 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CftrP26361 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CftrP26361 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CftrP26361 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CftrP26361 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CftrP26361 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CftrP26361 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CftrP26361 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CftrP26361 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CftrP26361 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CftrP26361 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CftrP26361 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CftrP26361 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CftrP26361 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CftrP26361 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CftrP26361 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CftrP26361 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CftrP26361 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CftrP26361 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CftrP26361 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CftrP26361 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CftrP26361 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CftrP26361 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CftrP26361 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CftrP26361 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CftrP26361 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CftrP26361 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CftrP26361 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CftrP26361 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CftrP26361 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CftrP26361 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CftrP26361 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CftrP26361 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CftrP26361 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CftrP26361 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CftrP26361 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CftrP26361 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CftrP26361 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CftrP26361 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CftrP26361 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CftrP26361 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CftrP26361 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CftrP26361 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CftrP26361 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CftrP26361 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CftrP26361 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CftrP26361 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms