Protein–RNA interactions for Protein: P26049

Gabra3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra3P26049 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabra3P26049 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabra3P26049 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabra3P26049 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabra3P26049 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabra3P26049 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabra3P26049 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra3P26049 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra3P26049 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra3P26049 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra3P26049 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra3P26049 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra3P26049 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra3P26049 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra3P26049 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra3P26049 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra3P26049 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra3P26049 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra3P26049 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra3P26049 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra3P26049 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra3P26049 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra3P26049 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra3P26049 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra3P26049 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra3P26049 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra3P26049 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra3P26049 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra3P26049 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra3P26049 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra3P26049 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra3P26049 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra3P26049 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra3P26049 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra3P26049 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra3P26049 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra3P26049 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra3P26049 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra3P26049 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra3P26049 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra3P26049 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra3P26049 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra3P26049 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra3P26049 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra3P26049 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra3P26049 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra3P26049 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra3P26049 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra3P26049 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra3P26049 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra3P26049 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra3P26049 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra3P26049 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gabra3P26049 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gabra3P26049 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gabra3P26049 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra3P26049 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms