Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms