Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsta3P23591 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms