Protein–RNA interactions for Protein: P23299

Kcne1, Potassium voltage-gated channel subfamily E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcne1P23299 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcne1P23299 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcne1P23299 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcne1P23299 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcne1P23299 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcne1P23299 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcne1P23299 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcne1P23299 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcne1P23299 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcne1P23299 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcne1P23299 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcne1P23299 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcne1P23299 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcne1P23299 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcne1P23299 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcne1P23299 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcne1P23299 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcne1P23299 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcne1P23299 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcne1P23299 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcne1P23299 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcne1P23299 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcne1P23299 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcne1P23299 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcne1P23299 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcne1P23299 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcne1P23299 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcne1P23299 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms