Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkchP23298 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkchP23298 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkchP23298 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkchP23298 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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