Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PparaP23204 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PparaP23204 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PparaP23204 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PparaP23204 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PparaP23204 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PparaP23204 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PparaP23204 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PparaP23204 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PparaP23204 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PparaP23204 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PparaP23204 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PparaP23204 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PparaP23204 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PparaP23204 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PparaP23204 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PparaP23204 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PparaP23204 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PparaP23204 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PparaP23204 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PparaP23204 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PparaP23204 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PparaP23204 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PparaP23204 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PparaP23204 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PparaP23204 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PparaP23204 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PparaP23204 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PparaP23204 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PparaP23204 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PparaP23204 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PparaP23204 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PparaP23204 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PparaP23204 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PparaP23204 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PparaP23204 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PparaP23204 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PparaP23204 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PparaP23204 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PparaP23204 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PparaP23204 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PparaP23204 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PparaP23204 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PparaP23204 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PparaP23204 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PparaP23204 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PparaP23204 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PparaP23204 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PparaP23204 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PparaP23204 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PparaP23204 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PparaP23204 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PparaP23204 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PparaP23204 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PparaP23204 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PparaP23204 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PparaP23204 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PparaP23204 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PparaP23204 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PparaP23204 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PparaP23204 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PparaP23204 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PparaP23204 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PparaP23204 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PparaP23204 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PparaP23204 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PparaP23204 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PparaP23204 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PparaP23204 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PparaP23204 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PparaP23204 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PparaP23204 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PparaP23204 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PparaP23204 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PparaP23204 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PparaP23204 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PparaP23204 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PparaP23204 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PparaP23204 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PparaP23204 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PparaP23204 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PparaP23204 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PparaP23204 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PparaP23204 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PparaP23204 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PparaP23204 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PparaP23204 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PparaP23204 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PparaP23204 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PparaP23204 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PparaP23204 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PparaP23204 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PparaP23204 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PparaP23204 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PparaP23204 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PparaP23204 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PparaP23204 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PparaP23204 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PparaP23204 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PparaP23204 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms